У новорожденных для разграничения материнских антител от собственных, обусловленных инфицированием ВИЧ, проводят определение в сыворотке крови ВИЧ-специфических иммуноглобулинов классов А и М, которые не проходят через плаценту. Иммуноглобулин M анти-ВИЧ может появляться в крови инфицированного новорожденного на 2-3-м месяце жизни. Однако их выработка у ребенка с незрелой иммунной системой не является закономерной. В связи с этим их отсутствие не позволяет сделать заключение об инфицированности новорожденного.
Напротив, выявление иммуноглобулина A является высокочувствительным и специфическим методом диагностики перинатальной ВИЧ-инфекции у детей старше 3 и особенно 6 мес жизни. Тем не менее в любом случае окончательный диагноз ВИЧ-инфекции у ребенка, рожденного ВИЧ-положительной матерью, устанавливается только, когда выявление ВИЧ-антител продолжается более 18 мес от рождения. В связи с задержкой появления у некоторых детей собственных антител к ВИЧ стандартные серологические реакции повторяются каждые 3-6 мес до 3-летнего возраста.
Использование метода ПЦР-диагностики и тестирования вирусной культуры в сочетании с определением антител к ВИЧ методом иммуноферментного анализа и иммуноблота позволяет определить ВИЧ-статус большинства детей, рожденных от ВИЧ-инфицированных матерей, в течение первого года. Так, получение трех отрицательных результатов исследования на ДНК ВИЧ в образцах крови, взятых с интервалом не менее 2 мес, позволяет при исчезновении у ребенка антител к ВИЧ и отсутствии клинических признаков заболевания снять диагноз у ребенка в возрасте 12 мес. И наоборот, ребенок, рожденный от ВИЧ-инфицированной женщины, считается инфицированным до 18 мес, если у него в двух или нескольких тестах получена культура ВИЧ, положительная ПЦР или выявлен антиген (согласно документам Европейского бюро ВОЗ и UNAIDS).