только для медицинских специалистов

Консультант врача

Электронная медицинская библиотека

Раздел 3 / 20
Страница 1 / 7

Глава 1. КЛАССИФИКАЦИЯ БАЗ ДАННЫХ В БИОИНФОРМАТИКЕ

Стартовой точкой создания курируемых биоинформационных ресурсов для всеобщего доступа можно считать создание Национального центра биотехнологической информации США (US National Center for Biotechnology Information, NCBI) в 1988 г. Далее, при реализации проекта «Геном человека» (Human Genome Project, HGP), возникла потребность хранить, распределять, анализировать и интерпретировать генетическую информацию. Для решения этих задач в 1992 г. на NCBI был запущен GenBank, БД нуклеотидных последовательностей, в сотрудничестве с международными партнерами в European Molecular Biology Laboratory (EMBL) и DNA Data Bank of Japan, DDBJ. Как только HGP декларировал секвенирование генома человека в 2001 г., был анонсирован HapMap Project. Данный проект был направлен на разработку карты гаплотипа человеческого генома, помогающей обнаружить наследственные факторы, связанные с развитием различных заболеваний. Полученные при реализации проекта результаты размещались в свободном доступе. Коллекция данных расширялась в разных направлениях: в вертикальном - от DNA к RNA и до белков; в горизонтальном - в соответствии с биологическими функциями и заболеваниями. Чтобы аннотировать биологические функции на различных уровнях анатомии и физиологии (клетка, орган, ткань, система), их необходимо привести в соответствие, что позволит интегрировать и интерпретировать данные для биологического применения.

Выделяют несколько типов данных, курируемых биоинформационными ресурсами:

► 1-й тип - масштабные данные «-омик», которые включают геном, транскриптом, протеом и метаболом (могут соответствовать различным заболеваниям);

► 2-й тип - данные, генерируемые молекулярной биологией (например, транскрипционные факторы и сигнальные пути, где структурно-функциональные взаимоотношения важны и значимы);

Для продолжения работы требуется вход / регистрация