Медицинская микробиология прошла огромный путь в своем развитии от изобретения микроскопа до прямой идентификации микроорганизмов в сообществах. Мы постараемся рассмотреть лишь главные вехи на этом пути.
Нам представляется, что начало медицинской микробиологии как науки было положено 30 апреля 1878 г. докладом «Теория микробов и ее применение в медицине и хирургии» Луи Пастера во Французской академии медицины. В конце XIX — начале XX в. медицинская микробиология стремительно развивалась: за это время были открыты основные возбудители инфекционных болезней человека и животных и изобретены способы их культивирования, которые используются и в наше время.
Во второй половине ХХ в. после открытия Джеймсом Уотсоном и Фрэнсисом Криком двойной спирали дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) классическая микробиология как бы ушла в тень, уступив место бурно развивающейся молекулярной биологии, для которой, казалось бы, нет ничего невозможного: нуклеотидная последовательность ДНК является «золотым стандартом» не только для идентификации любого живого организма, но и может помочь в определении чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам и даже в проведении типирования микроорганизмов, полезного при эпидемиологических исследованиях. И только с открытием протеомного анализа, появлением матрично-активированной лазерной десорбционной/ионизационной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) и ее внедрением в рутинную практику микробиологических лабораторий оказалось, что микроорганизмы можно идентифицировать еще проще и надежнее. В настоящее время проводятся и первые попытки определения чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам и даже типирования по спектру белков. Таким образом, MALDI-TOF MS как бы вдохнула новую жизнь, казалось бы, в уже увядающую область медицины — медицинскую микробиологию. К началу ХХ в. с помощью MALDI-TOF MS появилась возможность идентифицировать микроорганизмы за считаные минуты, что существенно сократило время анализа и изменило отношение клиницистов к микробиологическим исследованиям, основанным на культивировании микроорганизмов. Если раньше врачи, назначая такой анализ, понимали, что для получения ответа может потребоваться неделя, а то и две, то с внедрением MALDI-TOF MS-анализа в рутинную работу микробиологической лаборатории результат стали получать через 1–2 дня, что в ряде случаев является жизненно важным.
Поскольку в настоящее время одними из важнейших направлений развития медицинской помощи являются совершенствование методов диагностики и профилактики инфекционно-воспалительных заболеваний и мониторинг за возбудителями инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи в условиях стационара [1–7], внедрение в рутинную работу врача — медицинского микробиолога ускоренных и достоверных способов идентификации микроорганизмов считается приоритетной задачей.
Несмотря на постоянный поиск новых быстрых методов диагностики, а также способов лечения и профилактики инфекций, уровень инфекционных осложнений в стационарах по-прежнему остается высоким, а летальность достигает порой 5–26% [8–10].
Принимая во внимание скорость развития инфекционного процесса, становится очевидной значимость использования методов экспресс-диагностики. В частности, для раннего выявления инфекционных заболеваний большое значение придается серологической диагностике.
Особое внимание клиницистов в настоящее время приковано к оппортунистическим инфекциям — заболеваниям, обусловленным условно-патогенными микроорганизмами, которые обычно не вызывают заболеваний у здоровых людей. Условно-патогенные микроорганизмы, в норме колонизирующие кожные покровы, слизистые оболочки урогенитального и желудочно-кишечного трактов, нередко способны вызывать инфекционно-воспалительные заболевания у пожилых и ослабленных пациентов, а также у пациентов с приобретенными иммунодефицитными состояниями [11–16].
В диагностике оппортунистических инфекций важная роль принадлежит преаналитическому этапу исследования, в ходе которого лечащий врач по результатам предварительного клинического обследования пациента проводит различные диагностические (микробиологические) анализы. При этом все острее стоит вопрос о необходимости использования в рутинной практике методов так называемой быстрой микробиологии, которые позволят ускорить получение информации об этиологии инфекционного процесса и чувствительности возбудителей к антимикробным препаратам.
Большое разнообразие возбудителей оппортунистических инфекций, к числу которых относятся представители родов Staphylococcus, Enterococcus, Escherichia, Klebsiella, Enterobacter, Pseudomonas, Acinetobacter, Serratia и дрожжевые грибы рода Candida, существенно осложняет этиологическую диагностику и проведение своевременного адекватного лечения на всех этапах оказания медицинской помощи [17–19].
Известно, что широкое и не всегда оправданное применение антимикробных препаратов ведет к росту частоты случаев возникновения инфекций, вызванных антибиотикорезистентными микроорганизмами, в том числе госпитальными штаммами, которые легко проявляют свои патогенные свойства в отношении ослабленных и иммунокомпрометированных пациентов [20–23].
Несомненно, складывающаяся ситуация требует расширения и совершенствования методической базы, используемой для микробиологических исследований, с целью быстрого и качественного выявления возможных этиологических агентов инфекционных заболеваний [5, 24–26].